在“公司劳动仲裁5万怎么赔偿”的问题中，存在一些特殊情况会影响处理结果，以下为具体情形及影响：
1. 公司与员工存在特殊协议约定：若双方签订的劳动合同或补充协议中对赔偿金额有特殊约定（如约定离职时的经济补偿金额），且该约定不违反法律强制性规定，仲裁委可能优先按协议处理。例如：员工与公司约定离职时支付经济补偿5万，即使按法定标准计算应为6万，仲裁委也可能支持5万的约定金额。
2. 员工存在过错影响赔偿金额：若员工在争议中存在过错（如因个人原因导致公司损失），公司可提出抗辩，仲裁委可能酌情扣减赔偿金额。例如：员工主张公司违法解除赔偿5万，但公司举证员工严重违反规章制度，仲裁委可能认定解除合法，驳回5万的赔偿请求。
3. 涉及第三方责任的工伤赔偿：若工伤是因第三方侵权导致，员工可同时主张工伤赔偿和侵权赔偿，但部分费用（如医疗费）不能重复主张。例如：员工因第三方交通事故认定为工伤，主张5万工伤赔偿，但已从第三方获得3万医疗费赔偿，仲裁委可能扣除重复部分，仅支持2万的工伤赔偿差额。
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针对您咨询的“公司劳动仲裁5万怎么赔偿”，其法律依据主要来自《中华人民共和国劳动合同法》《工伤保险条例》等法律法规，以下为您具体分析：
根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十五条，用人单位拖欠劳动报酬、加班费或经济补偿的，劳动行政部门可责令其限期支付；逾期不支付的，责令按应付金额50%以上100%以下加付赔偿金。若您的5万主张为拖欠工资，需证明公司未足额支付劳动报酬。

若争议为违法解除劳动合同的赔偿金，依据《劳动合同法》第四十八条、第八十七条，公司违法解除的需按经济补偿标准的二倍支付赔偿金，经济补偿按工作年限每满一年支付一个月工资计算。若您的工作年限和工资水平对应赔偿金为5万，则符合法律规定。

若涉及工伤赔偿，根据《工伤保险条例》第三十条至第三十七条，工伤赔偿包括医疗费、伤残补助金等，需结合工伤认定和伤残等级确定金额，若经计算各项费用合计5万，则需按工伤保险规定执行。综上，5万赔偿需结合具体争议类型，依据对应法律条款确定是否合理。
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关于您提出的“公司劳动仲裁5万怎么赔偿”的问题，赔偿金额的确定需结合具体争议类型和实际情况。以下为您详细分析不同情形下的赔偿规则：
最直接的答案是：劳动仲裁5万的赔偿需根据争议类型（如工资、经济补偿、工伤等）及证据支持的金额确定。

1. 若争议为拖欠工资：赔偿金额以实际拖欠的工资金额为基础，若公司存在无故拖欠，还可能需加付赔偿金（标准为拖欠金额的50%-100%）。
2. 若争议为违法解除劳动合同的经济赔偿金：按员工工作年限×月平均工资×2计算，若该金额合计为5万，则按此执行。
3. 若争议为工伤赔偿：需结合工伤等级对应的一次性伤残补助金、医疗补助金等项目，若各项费用总和经计算为5万，则按工伤标准赔偿。
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在处理“公司劳动仲裁5万怎么赔偿”的问题时，部分当事人可能会出现错误操作，影响仲裁结果，以下为常见错误：
1. 证据提交不完整或逾期：部分当事人未在规定时间内提交关键证据（如工资流水、工伤鉴定书），或提交的证据无法直接证明主张，导致仲裁委无法支持5万的赔偿请求。
2. 忽视仲裁时效：劳动争议仲裁时效为一年，若超过时效才申请仲裁，即使主张合理，也可能因时效问题被驳回，无法获得5万赔偿。
3. 盲目接受公司的不合理调解：部分当事人在公司提出低于5万的调解方案时，未评估自身合法权益就轻易同意，导致实际获得的赔偿远低于应得金额。

若您担心出现上述错误，或对仲裁流程不熟悉，建议及时向专业律师咨询，避免因操作不当影响自身权益。

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